На 32 битной версии для Linux есть не все парсеры. Если вы используете 64 битную версию Linux, то скачайте версию A-Parser для неё.
Эти ссылки в файле результате появляютсям потому что в формате результатов стоит $query. Оставьте только $p1.preset и ссылок в результате не будет. Более подробно о форматировании результатов вы можете прочитать по ссылке
Понял, я с одменом сейчас все порешаю, и если что свяжусь. Хочу в очередной раз поблагодарить за отличный продукт и качественную поддержку.